Возможные варианты: 1. настроить grub, чтобы он выбирал Windows по умолчанию и ждал меньше. 2. восстановить загрузчик Windows в MBR (или просто выбирать его, если стоит загрузка по UEFI), затем можно безболезненно сносить разделы с Linux.