1. Как вы кастомизируете свои темы для Wordpress?
Если речь идет о доработке готового проекта, то чаще всего использую дочерние темы + плагин Advanced Custom Fields (ACF). Дочерняя тема нужна чтобы разделить нативные файлы темы и собственные доработки. ACF нужен для удобного интерфейса редактирования страниц и более быстрого создания шаблонов.
2. Используете что-то типа Unyson?
Для проектов из разряда «дешево и сердито» раньше брал https://toolset.com/
Кастомные типы записи и таксономию делаю с помощью https://generatewp.com/
80% всех задача решает Advanced Custom Fields Pro, остальные плагины смотрю под конкретный проект
3. Верстать тему ручками моветон?
Создание тем для конкретного проекта, на продажу и для репозитория вордпресс -- очень разные задачи. Могу рассказать про коммерческие проекты, когда есть готовый (кастомный) дизайн.
а) В большинстве случаев стартовые темы -- отлично подходят. Используйте ту, которую понимаете и нативно используете ее функционал.
б) Если стартовая тема построена на фреймворке (например Bootstrap) это может стать дополнительным плюсом в случае если дизайн «ложится» в сетку фреймворка. Для себя выбрал тему _Tk от Theme Kraft (Bootstrap 3).
в) Если нужен лендинг, с каким-то мега-дизайном, который не ложится ни в одну сетку, а по функционалу нужна только одна страница -- проще сверстать и на основе верстки создать новую тему с минимом файлов.