Любая работа должна быть оплачена. За исключением исправления своих ошибок. Тут Ваших ошибок нет, на мой взгляд. Так что смело ставьте ценник за восстановление. Но учтите, что надо заранее оговорить, что это не финальная версия. Он же мог там много что менять. Что бы потом Вы не оказались виновным в откате к первой версии сайта.